Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLN6Q9NWW5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLN6Q9NWW5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms