Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM248Q9NWD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM248Q9NWD8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM248Q9NWD8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms