Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GINM1Q9NU53 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GINM1Q9NU53 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINM1Q9NU53 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GINM1Q9NU53 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms