Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8A2Q9NTI2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8A2Q9NTI2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8A2Q9NTI2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8A2Q9NTI2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8A2Q9NTI2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8A2Q9NTI2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8A2Q9NTI2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8A2Q9NTI2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8A2Q9NTI2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP8A2Q9NTI2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP8A2Q9NTI2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8A2Q9NTI2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms