Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SNTG1Q9NSN8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNTG1Q9NSN8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms