Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM7SF3Q9NS93 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM7SF3Q9NS93 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM7SF3Q9NS93 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms