Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LTBP3Q9NS15 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP3Q9NS15 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
LTBP3Q9NS15 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LTBP3Q9NS15 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTBP3Q9NS15 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LTBP3Q9NS15 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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