Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMPRSS4Q9NRS4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMPRSS4Q9NRS4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS4Q9NRS4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms