Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
TULP4Q9NRJ4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TULP4Q9NRJ4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TULP4Q9NRJ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TULP4Q9NRJ4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TULP4Q9NRJ4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms