Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTPS2Q9NRF8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTPS2Q9NRF8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTPS2Q9NRF8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms