Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM7Q9NQW5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDM7Q9NQW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDM7Q9NQW5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms