Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRPL40Q9NQ50 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MRPL40Q9NQ50 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MRPL40Q9NQ50 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms