Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MKKSQ9NPJ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MKKSQ9NPJ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MKKSQ9NPJ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms