Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
A4GALTQ9NPC4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A4GALTQ9NPC4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms