Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GPCPD1Q9NPB8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GPCPD1Q9NPB8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GPCPD1Q9NPB8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1050.1 ms