Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XKR8Q9H6D3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XKR8Q9H6D3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
XKR8Q9H6D3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms