Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF41Q9H4P4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF41Q9H4P4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF41Q9H4P4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF41Q9H4P4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms