Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RIBC2Q9H4K1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RIBC2Q9H4K1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RIBC2Q9H4K1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms