Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EHD4Q9H223 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EHD4Q9H223 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EHD4Q9H223 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EHD4Q9H223 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EHD4Q9H223 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EHD4Q9H223 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EHD4Q9H223 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EHD4Q9H223 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EHD4Q9H223 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EHD4Q9H223 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EHD4Q9H223 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EHD4Q9H223 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EHD4Q9H223 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EHD4Q9H223 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EHD4Q9H223 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EHD4Q9H223 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
EHD4Q9H223 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EHD4Q9H223 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EHD4Q9H223 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EHD4Q9H223 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EHD4Q9H223 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EHD4Q9H223 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EHD4Q9H223 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EHD4Q9H223 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EHD4Q9H223 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EHD4Q9H223 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
EHD4Q9H223 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EHD4Q9H223 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EHD4Q9H223 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EHD4Q9H223 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EHD4Q9H223 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EHD4Q9H223 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EHD4Q9H223 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EHD4Q9H223 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EHD4Q9H223 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms