Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3FQ9H1D9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3FQ9H1D9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3FQ9H1D9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3FQ9H1D9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR3FQ9H1D9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR3FQ9H1D9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR3FQ9H1D9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms