Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B3GNT4Q9C0J1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
B3GNT4Q9C0J1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B3GNT4Q9C0J1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms