Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR12Q9C0I1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR12Q9C0I1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR12Q9C0I1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms