Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL4Q9C0H6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL4Q9C0H6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL4Q9C0H6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms