Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CIPCQ9C0C6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CIPCQ9C0C6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CIPCQ9C0C6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms