Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPEB1Q9BZB8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPEB1Q9BZB8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPEB1Q9BZB8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms