Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BCO2Q9BYV7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BCO2Q9BYV7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCO2Q9BYV7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms