Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
FANCD2Q9BXW9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
FANCD2Q9BXW9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
FANCD2Q9BXW9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.09
FANCD2Q9BXW9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC40.57■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
FANCD2Q9BXW9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
FANCD2Q9BXW9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
FANCD2Q9BXW9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC40.35■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms