Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TM2D1Q9BX74 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TM2D1Q9BX74 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms