Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF7Q9BWX1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF7Q9BWX1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHF7Q9BWX1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF7Q9BWX1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms