Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF3B5Q9BWJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF3B5Q9BWJ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SF3B5Q9BWJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms