Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIGD2AQ9BW72 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms