Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB2BQ9BVA1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB2BQ9BVA1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms