Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THUMPD3Q9BV44 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms