Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHCHD7Q9BUK0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHCHD7Q9BUK0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms