Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBB6Q9BUF5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms