Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC1Q9BTT6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC1Q9BTT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms