Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RTKNQ9BST9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTKNQ9BST9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RTKNQ9BST9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms