Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZKSCAN3Q9BRR0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZKSCAN3Q9BRR0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZKSCAN3Q9BRR0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms