Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
REEP2Q9BRK0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
REEP2Q9BRK0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
REEP2Q9BRK0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
REEP2Q9BRK0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms