Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MESP1Q9BRJ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MESP1Q9BRJ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms