Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ24

ZFYVE21, Zinc finger FYVE domain-containing protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE21Q9BQ24 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFYVE21Q9BQ24 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZFYVE21Q9BQ24 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZFYVE21Q9BQ24 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms