Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCAPGQ9BPX3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCAPGQ9BPX3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCAPGQ9BPX3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms