Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID3AQ99856 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID3AQ99856 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID3AQ99856 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms