Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BARD1Q99728 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BARD1Q99728 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARD1Q99728 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms