Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX2Q99697 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITX2Q99697 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITX2Q99697 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX2Q99697 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PITX2Q99697 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX2Q99697 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX2Q99697 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX2Q99697 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX2Q99697 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX2Q99697 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX2Q99697 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX2Q99697 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX2Q99697 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX2Q99697 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX2Q99697 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX2Q99697 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX2Q99697 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX2Q99697 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX2Q99697 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX2Q99697 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX2Q99697 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX2Q99697 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX2Q99697 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms