Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGREF1Q99674 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGREF1Q99674 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms