Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHP1Q99653 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHP1Q99653 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHP1Q99653 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHP1Q99653 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHP1Q99653 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHP1Q99653 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHP1Q99653 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHP1Q99653 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms