Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MMP19Q99542 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP19Q99542 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP19Q99542 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms