Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EYA3Q99504 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EYA3Q99504 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EYA3Q99504 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms