Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YME1L1Q96TA2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
YME1L1Q96TA2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
YME1L1Q96TA2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
YME1L1Q96TA2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms